Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BckdkO55028 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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BckdkO55028 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BckdkO55028 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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