Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChkaO54804 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms