Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Opn1mwO35599 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Opn1mwO35599 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Opn1mwO35599 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Opn1mwO35599 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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