Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
ColqO35348 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ColqO35348 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms