Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms