Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Auts2-217ENSMUST00000187544 3166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm16485-201ENSMUST00000104915 3983 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm37459-201ENSMUST00000192259 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Otog-202ENSMUST00000209802 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Ccdc120-201ENSMUST00000033490 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrkcshO08795 Gabpa-202ENSMUST00000114184 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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