Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms