Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20795J3QP49 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms