Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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