Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms