Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubgcp6G5E8P0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms