Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp72F8VQC1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms