Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cdh5-201ENSMUST00000034339 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Chrna5-201ENSMUST00000093844 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc30a2-204ENSMUST00000105874 3153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Vill-201ENSMUST00000051386 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sez6-201ENSMUST00000000646 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pmm2-201ENSMUST00000023396 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc7a8-201ENSMUST00000022787 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gls-203ENSMUST00000114512 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm14258-201ENSMUST00000144607 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms