Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SmgcF6VRN1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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