Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc175E9PVB3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.8 ms