Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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