Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5930D3Z257 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm5930D3Z257 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms