Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usf3B2RUQ2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usf3B2RUQ2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms