Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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