Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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