Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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