Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Tmem238A9JSM3 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Tmem238A9JSM3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms