Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5938A2AEN9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms