Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms