Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms