Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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