Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms