Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms