Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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