Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ms4a4bQ9ES61 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ms4a4bQ9ES61 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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