Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Clstn1Q9EPL2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Clstn1Q9EPL2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms