Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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