Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Nop56Q9D6Z1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nop56Q9D6Z1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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