Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Lamp5Q9D387 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Lamp5Q9D387 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms