Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Trappc6bQ9D289 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Trappc6bQ9D289 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Trappc6bQ9D289 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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