Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9D1F3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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