Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms