Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms