Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Cnot11Q9CWN7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnot11Q9CWN7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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