Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atxn3Q9CVD2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atxn3Q9CVD2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Atxn3Q9CVD2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms