Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms