Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Nicn1Q9CQM0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms