Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms