Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4Q99P72 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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