Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdac9Q99N13 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac9Q99N13 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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