Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp1b4Q99ME6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms