Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms