Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rab28Q99KL7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rab28Q99KL7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rab28Q99KL7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rab28Q99KL7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Rab28Q99KL7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab28Q99KL7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms