Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dok4Q99KE3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dok4Q99KE3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dok4Q99KE3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dok4Q99KE3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Dok4Q99KE3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms