Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Lims1Q99JW4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lims1Q99JW4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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